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एक प्रमुख दवा प्रतिरोधी हेपेटाइटिस सी वायरस उत्परिवर्तन के लिए नई पहचान विधि

Anonim

दवा प्रतिरोधी हेपेटाइटिस सी वायरस (एचसीवी) उत्परिवर्ती का पता लगाने के लिए एक तेज, संवेदनशील और सटीक विधि विकसित की गई है। हिरोशिमा विश्वविद्यालय के शोधकर्ताओं ने एचसीवी वाई 9 3 एच दवा प्रतिरोधी उत्परिवर्ती उपभेदों की उपस्थिति को तेजी से और सटीक रूप से मापने के लिए एक प्रणाली की स्थापना की, और उपचार से पहले इस उत्परिवर्तन को बरकरार रखने वाले मरीजों के अनुपात का मूल्यांकन किया। यहां तक ​​कि कम एचसीवी टाइमर वाले सीरम नमूनों में भी, Y93H दवा प्रतिरोधी उत्परिवर्तन नमूने के आधे से अधिक में सफलतापूर्वक पता लगाया जा सकता है। उत्परिवर्ती उपभेदों का पता लगाने के लिए यह नई प्रणाली न केवल उपचार निर्णयों के लिए महत्वपूर्ण है, बल्कि एचसीवी जीनोटाइप 1 बी रोगियों में रोग की प्रगति की भविष्यवाणी के लिए महत्वपूर्ण पूर्व-उपचार जानकारी प्रदान कर सकती है।

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एचसीवी क्रोनिक यकृत रोग, यकृत सिरोसिस, और हेपेटोकेल्युलर कार्सिनोमा का एक प्रमुख कारण है, जो दुनिया भर में 180 मिलियन लोगों को प्रभावित करता है। एचसीवी अक्सर प्रत्यक्ष अभिनय एंटीवायरल एजेंटों के खिलाफ प्रतिरोध प्राप्त करता है। उपचार से पहले Y93H उत्परिवर्तन की उपस्थिति वायरोलॉजिकल विफलता के एक महत्वपूर्ण भविष्यवाणी के रूप में रिपोर्ट की गई है। प्रत्यक्ष उत्परिवर्तन इस उत्परिवर्तन का पता लगाने के लिए एक सामान्य रूप से उपयोग की जाने वाली विधि है। हालांकि, यह केवल कम से कम 10% से 20% की आवृत्तियों के साथ वायरल उप-जनसंख्या का पता लगाने में सक्षम है। अगली पीढ़ी के अनुक्रम को हाल ही में वायरल उत्परिवर्तनों का विश्लेषण करने के लिए एक और अधिक संवेदनशील विधि के रूप में लागू किया गया है, लेकिन यह अभी भी जटिल नैदानिक ​​उपयोग के लिए प्रदर्शन और महंगा है।

अच्छी तरह से डिजाइन किए गए प्राइमर्स और जांच के साथ नेस्टेड पीसीआर और आक्रमणकारी परख को मिलाकर, वाई 3 9एच दवा प्रतिरोधी उत्परिवर्तन कुल 702 जापानी एचसीवी जीनोटाइप 1 बी रोगियों में 98.9% की उच्च सफलता दर के साथ पाया जा सकता है।

"हमारे परख प्रणाली ने प्रत्यक्ष अनुक्रमण का उपयोग करने से Y93H के लिए बहुत कम पहचान सीमा भी दिखायी है, और इस विधि द्वारा प्राप्त Y93H आवृत्तियों को गहरे अनुक्रम विश्लेषण के साथ अच्छी तरह से सहसंबंधित किया गया है।" हिरोशिमा विश्वविद्यालय में इस अध्ययन के सिद्धांत जांचकर्ता प्रोफेसर काजूकी चायामा ने समझाया।

इस प्रणाली द्वारा अनुमानित Y93H उत्परिवर्ती तनाव वाले मरीजों का अनुपात 23.6% था, और यह दर वास्तविक समय के पीसीआर द्वारा मूल्यांकन की तुलना में तुलनीय है और जापानी आबादी में गहरी अनुक्रम और प्रत्यक्ष अनुक्रमण के बीच रैंक किया गया है, संभवतः यह दर्शाता है कि Y93H की निचली पहचान सीमा।

इस नई प्रणाली ने उच्च परख सफलता दर प्राप्त की और प्रत्यक्ष अनुक्रमण की तुलना में वाई 9 3 एच का पता लगाने में अधिक संवेदनशील था। Y93H तनाव का मूल्यांकन एचसीवी जीनोटाइप 1 बी रोगियों में रोग की प्रगति की भविष्यवाणी के लिए महत्वपूर्ण जानकारी प्रदान कर सकता है।

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कहानी स्रोत:

हिरोशिमा विश्वविद्यालय द्वारा प्रदान की जाने वाली सामग्री। नोट: सामग्री शैली और लंबाई के लिए संपादित किया जा सकता है।


जर्नल संदर्भ :

  1. सतोशी योशीमी, हिडेनोरी ओची, ईसुक मुराकामी, ताकुरो उचिडा, हिरोमी कान, सकुरा अकामात्सु, सी नेल्सन हेस, हिरोमी आबे, दाकि मिकी, नोबहुइको हिरगा, मिचियो इमामुरा, हिरोशी अिकाता, काज़ुआकी चायामा। Invigor Assay द्वारा जेनोटाइप 1 बी एचसीवी में ड्रग रेसिस्टेंट उत्परिवर्ती (NS5A-Y93H) तनाव आवृत्ति का रैपिड, संवेदनशील, और सटीक मूल्यांकनप्लोस वन, 2015; 10 (6): ई0130022 डीओआई: 10.1371 / journal.pone.0130022